卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
《妇人良方》序识别修制药物法度卷之一调经门月经绪论第一精血篇第二《产宝方》序论第三王子亨方论第四月水不调方论第五月水不通方论第六《养生必用》论经病第七室女月水不通方论第八室女经闭成劳方论第九血枯方论第
类证普济本事方
卷第一玉石部玉屑车渠金线矾波斯白矾金屑银屑石流黄绿盐紫骐竭珊瑚石蟹胡桐泪卷第二草部人参木香草犀根薇白兔藿无风独摇草人肝藤石海根越王余通草兜纳香风延母大瓠藤水海藻昆布阿魏荜茇酱延胡索红豆蔻肉豆蔻零陵香补
简介神农本草经读序凡例卷之一 上品卷之二 上品卷之三 中品卷之四 下品本草附录
养生随笔
序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
序凡例卷一·慎疾法语省身修德卫生总要饮食宜忌养生铭保命箴寡欲说延年六字诀惜三宝益五脏先时加谨摄生要言勿药须知十二段动功行功六字静功解十二时病为善去疾吕祖治百病符卷二·杂症头疾面疾眼疾耳疾鼻病口病唇病舌